GeneSetCart pour Google Chrome

Outil de gestion complète des ensembles de gènes

GeneSetCart est une extension Chrome gratuite conçue pour les chercheurs et les bioinformaticiens afin de gérer et d'analyser des ensembles de gènes provenant de diverses sources. Elle intègre sans effort des ensembles de gènes de Rummagene et RummaGEO, permettant aux utilisateurs d'enrichir leurs ensembles de données avec des co-expressions de gènes ou des interactions protéine-protéine. Cette application interactive basée sur le web prend en charge le téléchargement d'ensembles de gènes uniques ou multiples, permettant aux utilisateurs d'effectuer des opérations sur les ensembles telles que l'union, le consensus et l'intersection.

L'outil offre également des options de visualisation robustes, y compris des diagrammes de Venn, des cartes de chaleur, UMAP, des diagrammes SuperVenn et des graphiques UpSet, qui aident à illustrer les similitudes et les chevauchements entre les ensembles de gènes. De plus, GeneSetCart facilite l'analyse d'enrichissement fonctionnel grâce à des liens vers des outils externes comme Enrichr et KEA3, et il permet aux utilisateurs de sauvegarder leurs ensembles de gènes pour une analyse ou un partage futurs, ce qui en fait une ressource inestimable pour la génération d'hypothèses et l'intégration des connaissances.